Kåfjord kommune ligger på østsiden av Lyngenfjorden i Nord-Troms, og grenser til Storfjord kommune i sørvest, Lyngen kommune i vest, Nordreisa kommune i nord og Enontekiö kommune i Finland i sør. Kommunen er den mest fjellrike kommunen i Troms. Over 75% av arealet ligger mer en 600 meter over havet. Ca. 120 km² er dekt av skog, 30 km² er ferskvann og ca. 12 km² er jordbruksareal. Kystlinjen er 8 mil lang.