Il Morbo di Crohn è una infiammazione cronica granulomatosa della parete intestinale, che può interessare ogni tratto dell'apparato digerente,dalla bocca all'ano. Si può complicare con stenosi segmentarie e conseguenti ostruzioni intestinali, ascessi, fistole. La Colite Ulcerosa colpisce in genere il colon in tutto il suo decorso, anche se è riportato un interessamento dell'ileo, in alcuni casi. Si complica con emorragie, perforazioni intestinali e con le due complicanze più temibili: megacolon tossico e cancerizzazione. Alcuni sintomi di queste malattie sono comuni alla Sindrome da Intestino Irritabile (Colite spastica), che non è assolutamente correlata ad esse.