Initialement baptisée « île de la Passion », Clipperton fit partie des Établissements français d'Océanie à partir de 1936 puis de la Polynésie française jusqu'au 18 mars 1986. Elle fut alors rattachée directement au Premier ministre, qui exerçait son autorité par l'intermédiaire du Haut Commissaire de la République de Polynésie française, avant d'être directement administrée par le ministre de l’Outre-Mer depuis février 2007.