大學與學校夥伴協作中心 - 中心成立於1998年。成立的目的，是為了加強與本港中學、小學及幼稚園的合作，推展全人教育和優質教育。 滬港發展聯合研究所 - 由復旦大學和香港中文大學合作成立於2001年，聯合研究重大戰略性課題，以向政府部門和企業機構等提供政策性建議。 香港中文大學專業進修學院 - 研究及開發各種進修機會，制定具體進修計劃，開辦各種實用課程，以配合進修的實際需要。 香港中文大學人文學科研究所 - 成立於1991，專責培育、服務與統籌研究項目。 香港中文大學人類傳意科學研究所 - 成立於2004年。含人工耳渦及聽力康復、溝通障礙及兒童語言認知、傳意研究合作三研究中心。 中國古籍研究中心 - 成立於1988年。致力於校定整理中國古代全部傳世文獻，並收入電腦資料庫，提供研究及教育使用。 香港中文大學中國考古藝術研究中心 - 1987年成立了田野考古實驗室及考古隊。並從事研究、教學、出版及展覽等工作。 吳多泰中國語文研究中心 - 前身是1966年成立的中國語言學研究中心。主要成績為金文研究與古音研究。 當代中國文化研究中心 - 成立於1993年，宗旨是推動中國近現代思想和文化的研究。 翻譯研究中心 - 成立於1971年，初名翻譯中心。早年專門出中國文學英譯作品。1978年易名為比較文學與翻譯中心。1983年再經改組定為今名。 香港教育研究所 - 以1992年蒙田家炳基金會捐贈成立研究所。 普通話教育研究及發展中心 - 1997年與國家語言文字工作委員會普通話培訓測試中心簽定合作協議，並於1998年成立本中心。