近海海洋环境科学国家重点实验室（厦门大学） - 厦门大学近海海洋环境科学国家重点实验室于2005年3月获科技部正式批准建设。 大气科学及地球流体力学数值模拟国家重点实验室 - 实验室主要研究和发展地球流体（大气和海洋）宏观演变规律及机理的系统理论。 河口海岸学国家重点实验室 - 实验室主要从事河口海岸的应用基础研究。 海洋地质国家重点实验室 - 教育部直属国家重点实验室。 近海海洋环境科学国家重点实验室 - 实验室站在学科研究的前沿，面向经济建设的实际需求，既重视学科本身的发展，也重视国家经济建设中重大技术问题的研究。 遥感科学国家重点实验室 - 由中国科学院遥感信息科学重点实验室和北京师范大学遥感与地理信息系统研究中心联合组成。 黄土高原土壤侵蚀与旱地农业国家重点实验室 - 实验室是以黄土高原侵蚀环境调控和提高旱地农业生产力为研究方向，以解决黄土高原水土流失和干旱为目标。